一般原則要求：P3實驗室內，在保證實驗質量的同時，更要保證操作人員安全，杜絕環境污染。潔凈實驗室主要用于微生物學、生物醫學、生物化學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室統稱潔凈實驗室-生物安全實驗室。無菌試驗室、生物安全實驗室由主實功能驗室與其他實驗室及輔助功能用房組成。因此，實驗室內在保證一定的潔凈度條件下，必須呈現一定的負壓，確保室內污染氣體不泄漏。并要對室內污染物和氣體進行處理排放。
P3實驗（experiment)室建筑布局
P3實驗（experiment)室要與公共通道口隔離。實驗室凈化由于潔凈實驗室-生物安全實驗室內操作對象是危險性的微生物，對人體、動植物或環境具有危害，必須通過采用合理的空氣調節系統，保持潔凈實驗室-生物安全實驗室的相對負壓環境無論何時都不被破壞，以保證實驗室內危險性微生物不能向外部環境中擴散。從走廊入口或其他相鄰的實驗室進人該實驗室須通過兩道自動關閉的門。通道里有更衣室（可隨時淋浴）。實驗室人流物流要分開。人流是指進入實驗室操作人員必須通過淋浴室一更衣室（正壓氣閘（zhá)室）更換工作服一清潔走廊～負壓氣閘室～實驗室。離開實驗室順序與進入相反。物流是指所有進入實驗室的物品必須經過另一清潔走廊的傳遞窗進入，相反實驗室內的物品必須消毒處理后，再經過傳遞窗傳出。
1、氣壓與氣體排放
要備有真空系統設施，以保障實驗室內絕對的負壓。這一設施產生從清潔區到實驗室污染區的定向氣流。排出室外的空氣不準在建筑物內其他區域循環（continue)使用，而必須經過過濾和其他處理程序(procedure)排出。實驗室內各處的壓力梯度和潔凈度分別為淋浴室的壓力為常壓；正壓氣閘室壓力為高于常壓+10Pa、潔凈度為十萬級；清潔走廊壓力為-10Pa、潔凈度為十萬級；負壓氣閘室壓力為-20Pa、潔凈度為十萬級；P3負壓實驗室壓力為-30Pa、潔凈度為萬級（較好的可達五千級）。
經過二或三級生物安全高效粒子空氣過濾器(作用:過濾雜質等)（過濾效率(efficiency)99.995％）過濾的氣體，可直接或通過建筑物(building)排氣系統排出。通過建筑物排氣系統排出時，高效粒子空氣過濾器要以某種方式（如套簡裝置連接）連接到該系統上，以免影響生物安全柜或建筑物排氣系統的氣流不平衡。使用二級生物安全柜應至少12個月檢測、鑒定1次，排出的氣體可以在實驗（experiment)室內循環。安全柜內有可以產生氣溶膠的連續（Continuity)運行的離心機或其他儀器（appliance），氣體在進入實驗室或周圍環境之前，要通過高效粒子空氣過濾器過濾。
用液體消毒裝置和高效粒子空氣過濾器(作用:過濾雜質等)或采取其他相應的設備來保護真空系統，這些防護設備應便于經常維護及時更換。負壓氣閘（zhá)室門與負壓實驗（experiment)室門要互鎖，以保證操作人員進出時，實驗室與外界相對隔絕，以免污染區負壓大幅回升，室內氣體外泄。
2、其他設施
P3實驗（experiment)室均應備有洗手池。凈化實驗室控制系統是整個潔凈實驗室安全運行的神經中樞,由于潔凈實驗室-生物安全實驗室的實驗對象是危險性的微生物，出于嚴格控制污染的原則，它要求以最少的維護人員，運用最優化的管理維護手段，來實時監控每一個實驗室中設備所處的物理環境，保證實驗室運行過程中始終處于相對負壓環境，防止危險性微生物外泄。其出水控制（control)開關應是腳踩式、肘動式或自動開關式，固定在實驗室出口附近。墻的內表面、墻的地腳、地面和天花板應光潔、防水，以便于清洗。這些表面上的滲漏(seepage)處要密封，以便于進行空間消毒。如果實驗室要留窗子，一定要雙層玻璃，以保證絕對密封。實驗室空間要根據需要而定；實驗室物品要固定存放位置（position )，工作臺、操作柜和設備之間要便于清掃。工作臺面應不滲水、耐酸堿(acid-base)、耐有機溶劑(性狀:透明、無色的液體)和中等度耐熱。實驗室必要時可留有下水道，平時對外界密封。實驗室內排出的污水必須經過嚴格消毒處理方可排出。